巨型不明生物「禍威獸」接二連三出現,幾乎束手無策的日本政府集結了田村君男(西島秀俊)等多位專家,成立「禍威獸特設對策室」。就在禍威獸的危害升溫之際,大氣層外突然飛來一個銀色的巨人。專門負責巨人的分析官淺見弘子(長澤雅美),在報告中寫著:「超人力霸王(暫稱)、身分不明。」