2014年，東京。平凡的高中生．夏目曉有天遇上交通事故。當他再度睜開眼睛時，已身處於2030年東京灣裡一個走私組織的船上，而且還變成只剩下大腦的狀態。就在曉陷入慌亂之際，他與警察上園美波、仿生人阿爾瑪一同遭受覬覦神秘武器『EX-ARM』的敵人襲擊，陷入空前危機！
